Além das atividades realizadas nas áreas de Música, Artes Cênicas e Artes Visuais, a Funarte desenvolve diversas atividades e projetos que, apesar de interagirem com as áreas-fim, têm seus próprios espaços de atuação.

Alguns estão ligados às áreas-meio, à própria dinâmica operacional da Fundação: o Centro de Documentação e Informação em Arte (Cedoc), a memória da Funarte; o Canal Virtual, versão Web dos produtos e serviços da Fundação; e as Edições Funarte, setor que publica livros de interesse para a cultura brasileira.

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Todos estes projetos são coordenados pelo Centro de Programas Integrados (Cepin).